Поляничко Александр Михайлович

pol


Должность: доцент

Степень: к.ф.-м.н.

Молекулярная биофизика, НИИФ,
корп. «Л», комн. 240
(тел. 428-4526)
корп. «Л», комн. 239
(тел. 428-4410)
корп. «Л», комн. 338
(тел. 428-4410)

электронная почта

  • (более подробную информацию можно найти здесь)

    • Структура и функции хроматина
    • Негистоновые белки семейства HMGB
    • Линкерные гистоны семейства Н1
    • Комплексы ДНК с белками и неорганическими молекулами
    • Изучение структуры белков сыворотки крови при различных патологиях

    Гранты (текущие):

    РФФИ «Механизмы самосборки надмолекулярных структур на основе архитектурных белков хроматина» 2018-2020

    Проводимые в нашей группе исследования поддержаны грантами Российского Фонда Фундаментальных Исследований (РФФИ) и Правительства Санкт-Петербурга.

    Основные публикации:

    Главы в монографиях

    1. Chikhirzhina E., Starkova T., Kostyleva E., Polyanichko A. (2013) Spectroscopic study of the interaction of DNA with the linker histone H1 from starfish sperm reveals mechanisms of the formation of super condensed sperm chromatin, in: M.P. Marques, L.A.E. Batista de Carvalho, P.I. Haris (Eds.) Advances in Biomedical Spectroscopy: Spectroscopy of Biological Molecules, IOS Press, 2013, pp. 177-183. (ISBN 978-1-61499-183-0; DOI 10.3233/978-1-61499-184-7-177).
    2. Polyanichko A., Chikhirzhina E. (2013) Supramolecular organization of the complexes of DNA with chromosomal proteins HMGB1 and H1, in: M.P. Marques, L.A.E. Batista de Carvalho, P.I. Haris (Eds.) Advances in Biomedical Spectroscopy: Spectroscopy of Biological Molecules, IOS Press, 2013, pp. 185-190. (ISBN 978-1-61499-183-0; DOI 10.3233/978-1-61499-184-7-185).
    3. Polyanichko. A.M., Andrushchenko V.V., Bouř P., Wieser H. (2012) Vibrational circular dichroism studies of biological macromolecules and their complexes. In: “Circular Dichroism: Theory and Spectroscopy”, Edited by David S. Rodgers, Nova Science Publishers, Inc., New York, USA, 2011, pp. 67-126 (PDF).
    4. Tsankov D., Polyanichko A., Wieser H. (2011) Vibrational Circular Dichroism: Ensuring Quality of Pharmaceutical Products, In: “Handbook of Analysis and Pharmaceutical Quality. Pharmaceutical Sciences Encyclopedia: Drug Discovery, Development, and Manufacturing”, Edited by Shayne C. Gad, John Wiley & Sons, Inc, 1-41.
    5. Polyanichko A.M., Wieser H. (2007) Vibrational circular dichroism and its applications to Protein studies. In “Methods in Protein Structure and Stability Analysis: Vibrational Spectroscopy”, E. Permyakov and V. Uversky (Eds.), Nova Science Publishers, Inc., New York, USA, 2007, pp 267-302.

    Учебно-методические пособия

    1. Поляничко А.М. (2007) Электрофорез в агарозном геле. Учебно-методическое пособие, СПбГУ, 43 с.
    2. Поляничко А.М. (2007) Электрофорез в ПААГ. Учебно-методическое пособие, СПбГУ, 72 с.
    3. Пастон С.В., Поляничко А.М. (2010) Учебно-методическое пособие по курсу общей физики. Часть 1. Механика. СПбГУ, 2010. 74 с.

    Статьи в научных журналах

    1. Fonin A.V., Stepanenko O.V., Sitdikova A.K., Antifeeva I.A., Kostyleva E.I., Polyanichko A.M., Karasev M.M., Silonov S.A., Povarova O.I., Kuznetsova I.M., Uversky V.N., Turoverov K.K. (2019) Folding of poly-amino acids and intrinsically disordered proteins in overcrowded milieu induced by pH change. International Journal of Biological Macromolecules. Vol. 125, P. 244-255.
    2. Sych, T.S., Reveguk, Z.V., Pomogaev, V.A., Buglak, A.A., Reveguk, A.A., Ramazanov, R.R., Romanov, N.M., Chikhirzhina, E.V., Polyanichko, A.M., Kononov, A.I. (2018) Fluorescent Silver Clusters on Protein Templates: Understanding Their Structure. The Journal of Physical Chemistry C. Vol. 122, No. 51, P. 29549–58.
    3. Плотникова Л.В., Кобелева М.О., Борисов Е.В., Гарифуллин А.Д., Поволоцкая А.В., Волошин С.В., Поляничко А.М. (2018) Инфракрасная спектроскопия сыворотки крови пациентов с множественной миеломой. Цитология, Т. 60, Вып. 12, С. 1037-1042
    4. Чихиржина Е., Старкова Т., Поляничко А. (2018) Роль линкерных гистонов в структурной организации хроматина. 1. гистоны семейства Н1. Биофизика, Т. 63, Вып. 6, c. 1070–1078
    5. Чихиржина Е., Старкова Т., Костылева Е., Поляничко А. (2018) Влияние цисплатина на взаимодействие ДНК с ядерными белками HMGB1 и HMGB2. Цитология, Т. 60, Вып. 11, С. 923-926
    6. Плотникова Л.В., Поляничко А.М., Кобелева М.О., Никехин А.А., Успенская М.В., Каява А.В., Гарифуллин А.Д., Волошин С.В. (2018) Анализ сыворотки крови методом рефрактометрии при проведении противоопухолевой терапии у больных множественной миеломой. Оптика и спектроскопия, 124(1), С. 140-142.
    7. Belaya I., Chikhirzhina E., Polyanichko A. (2017) Interaction of DDP with bovine serum albumin facilitates formation of the protein dimers. Journal of Molecular Structure. 1140, 148-153.
    8. Sych T., Polyanichko A., Kononov A. (2017) Albumin-stabilized fluorescent silver nanodots. Journal of Molecular Structure. 1140, 19-21.
    9. Плотникова Л.В., Поляничко А.М., Кобелева М.О., Успенская М.В., Гарифуллин А.Д., Волошин С.В. (2017) Рефрактометрический метод исследования уровня протеинемии и электролитных нарушений в сыворотке крови больных множественной миеломой // Научно-технический вестник информационных технологий, механики и оптики. 2017. Т. 17. № 2. С. 263–268.
    10. Пастон С.В., Поляничко А.М., Шуленина О.В. (2017) Исследование взаимодействия ДНК с ионами Cu2+ и Mg2+ в присутствии кофеина. Журнал Структурной Химии, Т. 58, №2, С. 417-423.
    11. Starkova T.Yu., Polyanichko A.M. Artamonova T.O, Khodorkovskii M.A., Kostyleva E.I., Chikhirzina E.V., Tomilin A.N. (2017) Post-translational modifications of linker histone H1 variants in mammals. Physical Biology, Vol. 14, art. Nr. 016005.
    12. Plotnikova L., Polyanichko A., Kobeleva M., Uspenskaya M., Garifullin A.,Voloshin S. (2017). The influence of protein fractions and electrolyte imbalance on refractive index of serum in patients with multiple myeloma. Journal of Physics: Conference Series. 784(1), 012047.
    13. Поляничко А.М., Михайлов Н.В., Романов Н.М., Баранова Ю.Г., Чихиржина Е.В. (2016) Межмолекулярные взаимодействия сывороточного альбумина в растворе. Цитология, Т. 58., № 9, С. 707-713.
    14. Plotnikova L., Polyanichko A., Nosenko T., Uspenskaya M., Garifullin A., Voloshin S. (2016) Characterization of the infrared spectra of serum from patients with multiple myeloma. AIP Conf. Proc. 1760, 020052.
    15. Chikhirzhina E.V., Chikhirzhina G.I., Polyanichko A.M. (2014) Chromatin structure: The role of “linker” proteins. Biomedical Spectroscopy and Imaging , 3(4), 345-358.
    16. Поляничко А.М., Романов Н.М., Старкова Т.Ю., Костылева Е.И., Чихиржина Е.В. (2014) Анализ вторичной структуры линкерного гистона H1 по спектрам инфракрасного поглощения, Цитология, 56(4), С. 316-322 (Polyanichko A.M., Romanov N.M., Starkova T.Y., Kostyleva E.I., Chikhirzhina E.V. (2014) Analysis of the secondary structure of linker histone H1 based on IR absorption spectra. Cell and Tissue Biology, 8(4), 352-358).
    17. Chikhirzhina E.V., Starkova T.Ju., Polyanichko A.M. (2014) Interaction between chromosomal protein HMGB1 and DNA studied by DNA-melting analysis. Journal of spectroscopy, vol. 2014, Article ID 387138.
    18. Поляничко А.М., Воробьёв В.И., Чихиржина Е.В., (2013) Структура комплексов ДНК с хромосомным белком HMGB1 и гистоном Н1 в присутствии ионов марганца. II. Спектроскопия кругового дихроизма в ИК области. Мол. биол., 47(2), 338-46.
    19. Polyanichko A., Chikhirzhina E. (2013) Interaction between DNA and chromosomal proteins HMGB1 and H1 studied by IR/VCD spectroscopy. J. Mol. Struct., 1044, 167-172.
    20. Polyanichko A., Chikhirzhina E. (2012) Interaction between Nonhistone Protein HMGB1 and Linker Histone H1 Facilitates the Formation of Structurally Ordered DNA-Protein Complexes. Spectroscopy: An International Journal, 27(5-6), P. 393-8.
    21. Chikhirzhina E., Starkova T., Kostyleva E., Polyanichko A. (2012) Spectroscopic Study of the Interaction of DNA with the Linker Histone H1 from Starfish Sperm Reveals Mechanisms of the Formation of Super Condensed Sperm Chromatin. Spectroscopy: An International Journal, 27(5-6), P. 433-40.
    22. Polyanichko A.M., Rodionova T.J., Vorob’ev V.I., Chikhirzhina E.V. (2011) Conformational Properties of Nuclear protein HMGB1 and Specificity of Its Interaction with DNA. Cell and Tissue Biology. (Поляничко А.М., Родионова Т.Ю., Воробьёв, В.И., Чихиржина Е.В. (2011) Конформационные особенности ядерного белка HMGB1 и специфика его взаимодействия с ДНК. Цитология, 53(2), 55-60).
    23. Chikhirzhina E.V., Starkova T.Yu., Kostyleva E.I., Chikhirzhina G. I., Vorobyev V.I., Polyanichko A.M. (2011) Interaction of DNA with Sperm-Specific Histones of the H1 Family. Cell and Tissue Biology, 5(6), 536-42. (Чихиржина Е.В., Старкова Т.Ю., Костылева Е.И., Чихиржина Г.И., Воробьев В.И., Поляничко А.М. (2011) Взаимодействие ДНК со спермий-специфическими гистонами семейства Н1, Цитология, 53(10), С. 826-31).
    24. Чихиржина Е.В., Поляничко А.М., Костылева Е.И., Воробьёв В.И. (2011) Структура комплексов ДНК с хромосомным белком HMGB1 и гистоном Н1 в присутствии ионов марганца. I. Спектроскопия кругового дихроизма. Мол. биол., 45(2), 356-65.
    25. Polyanichko A. and Wieser H. (2010) Structural organization of DNA–protein complexes of chromatin studied by vibrational and electronic circular dichroism. Spectroscopy: An International Journal, 24(3-4), p. 239-44.
    26. Chikhirzhina E., Polyanichko A., Leonenko Z., Wieser H., Vorob’ev V. (2010) C-terminal domain of nonhistone protein HMGB1 as a modulator of HMGB1–DNA structural interactions. Spectroscopy: An International Journal, 24(3-4), p. 361-6.
    27. Rodionova T.Y., Chikhirzhina E.V., Vorob’yov V.I., Polyanichko A.M. (2010) Changes in the secondary structure of HMGB1 protein bonded to DNA, Journal of Structural Chemistry, 50, 976-81 (Родионова Т.Ю., Чихиржина Е.В., Воробьев В.И., Поляничко А.М. (2009) Изменение вторичной структуры белка HMGB1 при связывании с ДНК. Журнал Структурной Химии, Т. 50, № 5, С. 1014-20).
    28. Поляничко А.М., Леоненко З.В., Крамб Д., Визер Г., Воробьев В.И., Чихиржина Е.В. (2008) Структурная организация комплексов ДНК с белками HMGB1 и HMGB1-(A+B). Биофизика, 53(3), С. 407-16.
    29. Polyanichko A.M., Chirkhirzhina E.V., Andrushchenko V.V., Vorob’ev V.I., Wieser H. (2006). The effect of manganese(II) on the structure of DNA/HMGB1/H1 complexes: electronic and vibrational circular dichroism studies. Biopolymers, 83(2), 182-92.
    30. Polyanichko A, Wieser H. (2005) The FTIR/VCD spectroscopy as an informative tool for the investigation of large supramolecular complexes of biological macromolecules. Biopolymers, 78(6), 329-39.
    31. Поляничко А.М., Чихиржина Е.В., Андрущенко В.В., Wieser H., Воробьёв В.И. (2005) Спектральные исследования структуры комплексов ДНК с ионами Mn2+ в УФ и ИК диапазонах. Биофизика, 50(5), 810-7.
    32. Polyanichko A.M., Andrushchenko V.V., Chikhirzhina E.V., Vorob’ev V.I., Wieser H. (2004) The effect of manganese(II) on DNA structure: electronic and vibrational circular dichroism studies. Nucleic Acids Res. 2004 Feb 10; 32(3):989-96.
    33. Поляничко А.М., Чихиржина Е.В., Костылева Е.И., Воробьев В.И. (2004) Структура комплексов ДНК с негистоновым хромосомным белком HMGB1 в присутствии ионов марганца. // Мол. Биол., 38(6), c. 1041-9.
    34. Поляничко А.М., Чихиржина Е.В., Андрущенко В.В., Костылева Е.И., Wieser H., Воробьев В.И. (2004) Влияние ионов Са2+ на компактизацию ДНК в комплексе с негистоновым хромосомным белком HMGB1. Молекулярная Биология, 38(4), с. 701-12.
    35. Polyanichko A.M., Chikhirzhina E.V., Skvortsov A.N., Kostyleva E.I., Colson P., Houssier C., Vorob’ev V.I. (2002) “The HMG1 Ta(i)le”, Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, 2002 Jun; 19(6):1053-62.
    36. Чихиржина Е.В., Поляничко А.М., Скворцов А.Н., Костылева Е.И., Уссье К., Воробьёв В.И. (2002) “HMG1-домены: заложники обстоятельств”, Молекулярная Биология, 36(3), с. 525-31.
    37. Поляничко А.М., Давыденко С.Г., Чихиржина Е.В., Воробьёв В.И. (2000) “Взаимодействие суперспиральной ДНК с негистоновым белком HMG1”, Цитология, 42(8), 787-93.

     

  • Курсы лекций:

    1. «Основы биохимии», 2 курс (ПМФ)
    2. «Введение в молекулярную биологию», 3 курс (ПМФ)
    3. «Структура и функции биополимеров», 4 курс (Физика)
    4. «Молекулярная спектроскопия», 5 курс (магистерская программа по профилю «Нанобиофизика»)
    5. «Структура и свойства биологических макромолекул», 5 курс (магистерская программа по профилю «Нейтронная и синхротронная физика»)
    6. «Дополнительные главы молекулярной спектроскопии», 6 курс (магистерская программа по профилю «Молекулярная биофизика»)

    Руководство кандидатскими, магистерскими и бакалаврскими работами:

    Выпускные квалификационные работы (бакалаврские):

    1. «Взаимодействие координационных соединений платины с биологическими макромолекулами» (Солдатова А.А. — 2018 г.)
    2. «ИК-Спектроскопия водных растворов ДНК в присутствии ионов металлов» (Тымченко Е.Е. — 2016 г.)
    3. «Образование надмолекулярных белковых комплексов в присутствии ионов металлов» (Андреева М.В. — 2016 г.)
    4. «ИК-спекстроскопия комплексов ДНК с ионами металлов» (Свистунов А.Е. — 2016 г.)
    5. «ИК-спектроскопия комплексов белков с ионами металлов» (Баранова Ю.Г. — 2015 г.)
    6. «Изучение взаимодействия линкерного гистона H1 и негистонового хромосомного белка HMGB1» (Созонова А.А. ‑ 2014 г.)
    7. «Взаимодействие ДНК с ядерными белками хроматина» (Савватеев А.Ю. ‑ 2014 г.)
    8. «Анализ вторичной структуры белков по спектрам ИК-поглощения» (Романов Н.М. ‑ 2013 г.)
    9. «Ассоциация белков хроматина H1 и HMGB1 в водно-солевых растворах» (Михайлов Н.В. ‑ 2013 г.)
    10. «Взаимодействие диамминодихлорплатины(II) с биологическими молекулами» (Белая И.А. ‑ 2013 г.)
    11. «Анализ посттрансляционных модификаций белков хроматина Н1 и HMGB1 методом МАЛДИ масс-спектрометрии» (Ситникова А.В. ‑ 2013 г.)

    Магистерские диссертации

    1. «Взаимодействие координационных соединений платины
      с ДНК и ядерными белками» (Тымченко Е.Е. — 2018 г.)
    2. «Взаимодействие белков H1 и HMGB1 в растворе» (Созонова А.А. — 2017 г.)
    3. «Межмолекулярные взаимодействия в растворах белков» (Баранова Ю.Г. — 2017 г.)
    4. «Анализ посттрансляционных модификаций линкерных белков хроматина методом масс-спектрометрии» (Бабич А.В. — 2015 г.)
    5. «Взаимодействие диамминодихлорплатины(II) c ДНК и белками» (Белая И.А. — 2015 г.)
    6. «Механизмы образования межмолекулярных белковых комплексов на примере белков БСА, H1 и HMGB1» (Михайлов Н.В. — 2015 г.)
    7. «Определение вторичной структуры белков в водном растворе по спектрам ик поглощения» (Романов Н.М. — 2015 г.)
    8. «Спектроскопические исследования кинетики взаимодействия координационных соединений платины с ДНК» (Огарков М.А. ‑ 2012 г.)
    9. «Исследование взаимодействия цис- и транс-дихлородиамминплатины(II) с биологическими молекулами» (Феофилова М.С. ‑ 2012 г.)
    10. «Взаимодействие HMGB-доменов с ДНК на примере негистонового белка хроматина HMGB1» (Родионова (Старкова) Т.Ю. — 2011 г.)
    11. «Изучение взаимодействия гистона Н1 с негистоновым белком HMGB1» (Кипенко И.Б. — 2011 г.)

     

  • Членство в советах:

    • Член диссертационного совета Д 212.232.33 при СПбГУ

  • ResearcherID: G-8225-2011
    ScopusID: 6602405202
    ORCID: 0000-0001-7695-3586
    SPIN-код: 2417-5760

Опубликовано в